Deux ans d'humains, soit douze années de renard, ont passé depuis que Mr. Fox a promis à son épouse qu'il cesserait de dévaliser les poulaillers de la région pour se consacrer à des activités honnêtes. Par ambition, ce père de famille devenu chroniqueur pour le journal local se laisse à nouveau tenter par le crime et, avec l'aide du castor qui a notarié sa nouvelle tanière, dévalise trois éleveurs de volaille industriels, sans appréhender leur colère. Laquelle prend des proportions telles que tous les animaux de la prairie se retrouvent expropriés par les bulldozers, et forcés de suivre la famille Fox à travers des tunnels souterrains en quête d'un lieu sûr. Habituellement rivaux, Ash, le fils complexé de Mr. Fox, et son cousin Kris, font équipe pour sortir la ménagerie de ce mauvais pas.
